Bezpečnosť je kľúčovým faktorom, ktorý treba zvážiť pri výbere generátora vysokého prúdu. Zariadenie by malo disponovať viacerými bezpečnostnými mechanizmami vrátane nadprúdovej ochrany, prepäťovej ochrany, ochrany proti skratu-a ochrany proti prehriatiu, aby sa zabezpečilo rýchle prerušenie napájania-v abnormálnych situáciách a zabránilo sa poškodeniu zariadenia alebo zraneniu osôb. Okrem toho sú dôležitými ukazovateľmi bezpečnosti aj izolačný výkon zariadenia, dizajn odvodu tepla a jednoduchá obsluha.